Das Ende ist nicht aktiviert, da die Festungen in der Oberwelt zum Teil dort liegen würden, wo bereits vor der Einführung Gelände generiert und bebaut wurde. Gefunden hat zumindest soweit ich weiß noch niemand eine. Die Enderperlen führen einen regelmäßig an Orte, wo keine Festung ist.
Da aber das Ende eh relativ wenig Nutzen hat (sehr begrenze Größe) haben wir die Endsteine einfach in den Nether verfrachtet.
Man könnte natürlich, da es jetzt auch weniger Endermen gibt, deren Spawnrate in der normalen Welt etwas erhöhen, oder sie im Nether spawnen lassen.
Vielleicht gibts da ja noch ein paar Meinungen/Vorschläge/Wünsche zu.

Durch das Deaktivieren des Endes spart man nebenbei auch ein klein wenig Rechenleistung auf dem Server, was zu weniger Lags führen sollte.