Eine MiniSD Karte ist einfach nur eine Weiterentwicklung der SD Karte. Da man nicht mehr viel weiterentwickeln konnte, hat man sie einfach kleiner gemacht. Ansonsten gibt es keinen Unterschied. Reborn und ich haben jeweils eine 1GB SD Karte und sind sehr zufrieden damit. Die MiniSD Version der Supercard/M3 ragen allerdings weniger weiter aus dem GBA Slot des NDS raus.
Auf die Supercard/M3 kannst du direkt nicht zugreifen. Du musst die SD Karte einfach in einen Cardreader stecken, dort deine Sachen raufmachen und in die Suercard stecken. Diese steckst du dann in den NDS und du bekommst ein Auswahlmenü.

Moonshell spielt folgende Formate ab:
DPG (NDS Video Format. Umwandler gibts im Netz)
MP3/NSF
Jpeg/BMP/PNG/TXT

Einen PDF Reader gibt es leider noch nicht. Aber ich hoffe noch drauf.